Die nachfolgende Liste von Bibliotheken und Sammlungen erhebt keinen Anspruch auf Vollständigkeit.

Der weitaus überwiegende Teil aller mittelalterlichen Handschriften in Österreich wurde ab 1965 von der Hill Museum & Manuscript Library (HMML), Saint John's University, Minnesota mikrofilimiert. Die Anzahl der von HMML verfilmten Handschriften ist den Bibliotheksnamen in Klammern nachgestellt. Vgl. Austrian microfilm collections - http://www.hmml.org/centers/austria_germany/austria/austrialist.htm

Ein aktuelles Verzeichnis der Kataloge zu den einzelnen Sammlungen ist in der Online-Ausgabe von Paul Oskar Kristeller, A List of the Printed Catalogues and Unpublished Inventories of Extant Collections abrufbar: http://www.mgh-bibliothek.de/kristeller/index.html

Admont, Benediktinerstift (779)
Altenburg, Benediktinerstift (228)
Bregenz, Kapuzinerkloster (3)
Bregenz, Wettingen-Mehrerau, Zisterzienserabtei (18)
Bregenz, Vorarlberger Landesarchiv (129)
Bregenz, Vorarlberger Landesmuseum
Brixen im Thale, Taz-Bibliothek
Bruck an der Leitha, Schloß Harrach
Feldkirch, Jesuitengymnasiums
Feldkirch, Jesuitenkolleg
Feldkirch, Kapuzinerkloster
Feldkirch, Stadtarchiv
Fiecht, Benediktinerstift (200)
Flaurling, Ris-Bibliothek (Depot an ULB Tirol)
Friesach, Dominikanerkloster
Friesach, Stadtpfarre St. Bartlmä
Geras, Prämonstratenserkloster (6)
Göttweig, Benediktinerstift (543)
Graz, Bibliothek des bischöfl. Ordinariats (3)
Graz, Diözesanarchiv (3)
Graz, Dominikanerkonvent (6)
Graz, Franziskanerkloster (41)
Graz, Stadtpfarre zum Hl. Blut (1)
Graz, Steiermärkisches Landesarchiv (179)
Graz, Steiermärkische Landesbibliothek
Graz, Steiermärkisches Landesmuseum Johanneum
Graz, Minoritenkonvent (heute: Wien, Minoritenkonvent) (1)
Graz, Universitätsbibliothek (1217)
Grein, Gemeindearchiv
Güssing, Franziskanerkloster (22)
Hall, Franziskanerkloster
Hall, Jesuiten
Haus im Ennstal, Pfarrarchiv (1)
Heiligenkreuz, Zisterzienserstift (391)
Herzogenburg, Augustiner-Chorherrenstift (126)
Innsbruck, Jesuitenkolleg
Innsbruck, Prämonstratenserkloster-Chorherrenstift Wilten (26)
Innsbruck, Servitenkloster (Depot an ULB Tirol) (25)
Innsbruck, Tiroler Landesarchiv (1097)
Innsbruck, Tiroler Landesmuseum (Ferdinandeum) (83)
Innsbruck, Universitäts- und Landesbibliothek Tirol (ULBT) (690)
Klagenfurt, Archiv der Diözese Gurk, Bischöfliche Bibliothek (179)
Klagenfurt, Gurker Domkapitel
Klagenfurt, Diözesanmuseum
Klagenfurt, Kärntner Landesarchiv, Geschichtsverein (222)
Klagenfurt, Kärntner Landesarchiv, Stadtarchiv Wolfsberg
Klagenfurt, Kapuzinerkloster (heute: Wien, Kapuzinerkloster) (1)
Klagenfurt, Priesterseminar
Klagenfurt, Universitätsbibliothek (214)
Klagenfurt, Handschrift Ernst Urbar
Klosterneuburg, Augustiner-Chorherrenstift (1270)
Korneuburg, Stadtarchiv
Krems, Stadtarchiv
Kremsmünster, Benediktinerstift (432)
Kreuzenstein, Sammlung Graf Wilczek (36)
Lambach, Benediktinerstift (405)
Leoben, Stadtmuseumx
Lilienfeld, Zisterzienserstift (230)
Linz, Bibl. der kath.-theol. Hochschule (11)
Linz, Oberösterr. Landesarchiv (489)
Linz, Oberösterr. Landesmuseum (9)
Linz, Stadtmuseum, Kapuzinerbibliothek (5)
Linz, Oberösterr. Landesbibliothek (219)
Linz, Priesterseminar
Maria Saal - Klagenfurt, Archiv der Diözese Gurk, Depot Maria Saal (45)
Mattsee, Collegiatstift (41)
Melk, Benediktinerstift (1105)
Michaelbeuren, Benediktinerstift (126)
Mistelbach, Salvatorianerkolleg
Persenbeug, Schloßarchiv
Petronell, Schloßbibl. der Grafen von Traun-Abensberg
Pörtschach, Dr. Neuscheller
Reichersberg, Augustinerchorherrenstift (12)
Rein, Zisterzienserstift (161)
Retz, Dominikanerkonvent
Retz, Stadtarchiv
Saalfeld, Stadtarchiv
Salzburg, Franziskanerkloster
Salzburg, Erzbischöfliches Konsistorialarchiv (1)
Salzburg, Landesarchiv, Kapuzinerbibliothek
Salzburg, Museum Carolino-Augusteum (20)
Salzburg, Nonnberg, Benediktinerinnenstift (195)
Salzburg, Erzbischöfliches Priesterseminar (21)
Salzburg, Erzabtei St. Peter, Benediktinerstift (925)
Salzburg, Universitätsbibliothek (501)
Salzburg, Universität, Institut für Germanistik
Sankt Florian, Augustiner-Chorherrenstift (544)
Sankt Lambrecht, Benediktinerstift
Sankt Paul im Lavanttal, Benediktinerstift (1043)
Sankt Pölten, Diözesanbibliothek und -museum (116)
Sankt Pölten, Diözesanarchiv
Sankt Pölten, Niederösterreichisches Landesarchiv
Sankt Pölten, Niederösterr. Landesarchiv, Regierungsarchiv
Sankt Pölten, Niederösterr. Landesarchiv, Ständisches Archiv
Sankt Pölten, Niederösterreichisches Landesmuseum, Museum für Rechtsgeschichte in Schloß Pöggstall
Sankt Pölten, Stadtarchiv
Schlägl, Prämonstratenserstift (246)
Schlierbach, Zisterzienserkloster (33)
Schwaz, Franziskanerkloster (11)
Seitenstetten, Benediktinerstift (282)
Solbad Hall, Franziskanerkloster (71)
Stams, Zisterzienserkloster (118)
Tulln, Stadtarchiv (Depot in St. Pölten, NÖLA)
Tulln, Stadtmuseum
Villach, Stadtmuseum (60)
Vorau, Augustiner-Chorherrenstift (364)
Waidhofen an der Thaya, Stadtarchiv
Weißenkirchen, Marktarchiv
Weitra, Pfarrarchiv
Weitra, Schloß Weitra, Landgraf Fürstenberg'sche Bibliothek
Weitra, Stadtarchiv
Wels, Stadtarchiv
Wien, Augustiner-Chorherrenstift St. Dorothea
Wien, Deutscher Orden, Zentralarchiv
Wien, Erzbischöfliche Bibliothek
Wien, Erzbischöfliche Cur
Wien, Erzbischöfliches Diözesanarchiv
Wien, Erzbischöfliches Diözesanarchiv, Kirnberger Bibliothek der Wiener Dompropstei
Wien, Erzbischöfliches Domkapitel
Wien, Dominikanerkonvent (251)
Wien, Haus-, Hof- und Staatsarchiv (301)
Wien, Institut für Österreichische Geschichtsforschung
Wien, Kapuzinerkloster
Wien, Kunsthist. Museum, Bibliothek
Wien, Kunsthist. Museum, geistliche Schatzkammer
Wien, Kunsthist. Museum, weltliche Schatzkammer
Wien, Kunsthist. Museum, Sammlung für Plastik und Kunstgewerbe
Wien, Kunsthist. Museum, Waffensammlung
Wien, Mechitaristenkongregation (1181)
Wien, Minoritenkonvent (232)
Wien, Museum für Angewandte Kunst
Wien, Österr. Nationalbibliothek (ÖNB) (14000)
Wien, Erzbischöfliches Priesterseminar
Wien, Schottenstift (466)
Wien, Stadt- und Landesarchiv
Wien, Theresianum (40)
Wien, Universitätsbibliothek
Wien, Universität, Institut für Österr. Geschichtsforschung
Wien, Wiener Bezirksmuseen
Wiener Neustadt, Stadtarchiv
Wiener Neustadt, Stadtmuseum
Wiener Neustadt, Neukloster (OCist)
Wilhering, Zisterzienserkloster (154)
Zwettl, Zisterzienserstift (441)